五条南迁之路：千例Y染色体序列重构新石器中国农业人群进入东南亚的父系扩张史

新石器时代，中国的农业人群如何向南进入东南亚？这一过程在语言、考古与遗传学上长期存在争议。四川大学何光林团队等在《科学·进展》发表研究，通过迄今最大规模的Y染色体序列整合，重建了高分辨率、时间校准的父系扩张史。

研究整合了三类数据：1507条高覆盖Y染色体序列、780例东亚古代基因组，以及1748条东南亚低覆盖序列。在此基础上构建的Y染色体系统发育树，具有较高的时间分辨率。结果识别出至少5次新石器时代农业人群由中国南向东南亚的男性主导扩张波次。

父系谱系上，O1与O2是主要贡献单倍群。其中O1a-M119、O1-F1252、O1-F789、O2-M7、O2-Z25921等五大谱系构成核心父系奠基者，其扩张窗口约在距今4000至6000年。这五次波次在地理与语言上分别对应南亚语系、南岛语系、侗台语系等人群的扩散。

与以往主要依赖现代人群单点数据的研究不同，本研究将古代东亚基因组一并纳入，使得谱系分歧时间能够与考古学文化序列相互参照。780例古代基因组的加入，让”哪一支谱系在何时已经出现在何地”这一问题有了直接的时间锚点。

三类数据的整合方式也值得说明。高覆盖Y染色体序列保证了内部谱系的精细划分，古代东亚基因组为分歧时间提供了考古学锚点，而东南亚低覆盖序列则补全了接收端的地理分布。正是这种”高精度父系树加古代时间锚”的组合，使研究者能够把南下过程拆成五次可区分的波次，而不再笼统地视为一次连续的人群扩散。

这一结果在父系水平上支持了农业人群南下东南亚的”人口扩散”（demic diffusion）模型——即农业技术的传播伴随着人群本身的迁移，而非单纯的文化要素传播。千例级别的Y染色体数据，使研究者能够区分不同时间窗的扩张事件，而不再将南下过程视为一次笼统的迁徙。研究者同时提醒，Y染色体只记录父系一条线，完整的人群史仍需结合常染色体与线粒体证据；但五条波次在语言地理上的一致性，已经为后续整合研究提供了清晰的父系骨架。

总体而言，这项工作为理解东亚与东南亚之间新石器时代的人群—农业—语言协同扩散，提供了迄今分辨率最高的父系遗传学框架之一。

来源：Mengge Wang, Yunhui Liu, Lintao Luo et al.; Guanglin He通讯. Science Advances, 2026-02-18。